Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copg2Q9QXK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms