Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdcQ9QW08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PdcQ9QW08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdcQ9QW08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms