Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prg3Q9JL95 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prg3Q9JL95 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prg3Q9JL95 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms