Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gde1Q9JL56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gde1Q9JL56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gde1Q9JL56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gde1Q9JL56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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