Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx6Q9JKK1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx6Q9JKK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stx6Q9JKK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms