Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ybx3Q9JKB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ybx3Q9JKB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ybx3Q9JKB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms