Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FliiQ9JJ28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FliiQ9JJ28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FliiQ9JJ28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms