Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1fQ9JIS7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1fQ9JIS7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms