Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Copb1Q9JIF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms