Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Brd4Q9ESU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Brd4Q9ESU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Brd4Q9ESU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Brd4Q9ESU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Brd4Q9ESU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms