Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hapln2Q9ESM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hapln2Q9ESM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms