Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hipk3Q9ERH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hipk3Q9ERH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hipk3Q9ERH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms