Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco1c1Q9ERB5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco1c1Q9ERB5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slco1c1Q9ERB5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slco1c1Q9ERB5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slco1c1Q9ERB5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms