Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms