Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Snap29Q9ERB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snap29Q9ERB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms