Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rnft1Q9DCN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft1Q9DCN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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