Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp27a1Q9DBG1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp27a1Q9DBG1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp27a1Q9DBG1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms