Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pop5Q9DB28 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pop5Q9DB28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms