Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms