Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Slc52a2Q9D8F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc52a2Q9D8F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc52a2Q9D8F3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc52a2Q9D8F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms