Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp5Q9D7S9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp5Q9D7S9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp5Q9D7S9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp5Q9D7S9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms