Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrps9Q9D7N3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrps9Q9D7N3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrps9Q9D7N3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms