Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Capns2Q9D7J7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capns2Q9D7J7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capns2Q9D7J7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms