Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D727 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D727 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D727 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D727 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D727 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D727 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D727 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D727 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D727 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D727 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D727 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D727 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D727 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D727 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D727 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms