Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rabl3Q9D4V7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rabl3Q9D4V7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rabl3Q9D4V7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabl3Q9D4V7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabl3Q9D4V7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabl3Q9D4V7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rabl3Q9D4V7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rabl3Q9D4V7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms