Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tssk4Q9D411 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tssk4Q9D411 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tssk4Q9D411 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms