Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ms4a4cQ9D3F6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ms4a4cQ9D3F6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms