Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D2Q3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D2Q3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D2Q3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms