Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fndc8Q9D2H8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fndc8Q9D2H8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fndc8Q9D2H8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms