Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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Snapc3Q9D2C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Snapc3Q9D2C9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Snapc3Q9D2C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Snapc3Q9D2C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Snapc3Q9D2C9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Snapc3Q9D2C9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Snapc3Q9D2C9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Snapc3Q9D2C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Snapc3Q9D2C9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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