Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snapc3Q9D2C9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snapc3Q9D2C9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snapc3Q9D2C9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms