Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd3Q9D176 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd3Q9D176 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd3Q9D176 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms