Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D131 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D131 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D131 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D131 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D131 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D131 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D131 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D131 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D131 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D131 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D131 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms