Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbed3Q9D0L1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Zbed3Q9D0L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zbed3Q9D0L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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