Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3100002H09RikQ9CXW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
3100002H09RikQ9CXW6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
3100002H09RikQ9CXW6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms