Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl11Q9CXW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl11Q9CXW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms