Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpusd4Q9CWX4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpusd4Q9CWX4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms