Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tdrd12Q9CWU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd12Q9CWU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms