Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CRC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CRC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CRC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CRC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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