Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029F12RikQ9CRB4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms