Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vta1Q9CR26 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vta1Q9CR26 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vta1Q9CR26 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vta1Q9CR26 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms