Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ykt6Q9CQW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ykt6Q9CQW1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ykt6Q9CQW1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms