Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl11Q9CQF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl11Q9CQF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl11Q9CQF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms