Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RTRAFQ9CQE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTRAFQ9CQE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTRAFQ9CQE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms