Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd2Q9CQ48 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nudcd2Q9CQ48 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nudcd2Q9CQ48 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms