Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms