Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StambpQ9CQ26 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StambpQ9CQ26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StambpQ9CQ26 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.7 ms