Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80bQ99PT3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80bQ99PT3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80bQ99PT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms