Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rad54l2Q99NG0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rad54l2Q99NG0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rad54l2Q99NG0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms