Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd1Q99MV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd1Q99MV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd1Q99MV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd1Q99MV1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.7 ms