Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KarsQ99MN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KarsQ99MN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KarsQ99MN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KarsQ99MN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms