Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpifQ99KR7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PpifQ99KR7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PpifQ99KR7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms