Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrabdQ99JY4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrabdQ99JY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrabdQ99JY4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrabdQ99JY4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms